(A-1) Articles published in journals indexed by SCI or SCI Expanded, SSCI, AHCI
1-) Türk Erdem, Yüksek Ayhan, Ayaz Akif, Süzek Barış Ethem, 2023. DEVOUR: Deleterious Variants on Uncovered Regions in Whole-Exome Sequencing. PEERJ
2-) Ibrahim Ahmad Hassan, Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2023. A correlation coefficient-based feature selection approach for virus-host protein-protein interaction prediction. PLOS ONE
3-) Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Ibrahım Ahmad Hassan, Süzek Barış Ethem, 2021. ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor. Frontiers in Molecular Biosciences
(A-3)
1-) Özkaraca Osman, Acar Ethem, Peker Musa, Türk Erdem, 2018. ACİL SERVİSLER İÇİN BULANIK MANTIK TABANLI BİR KLİNİK KARAR DESTEK SİSTEMİ. Mühendislik Bilimleri ve Tasarım Dergisi
(A-7)
1-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2019. Taxonomic diversity-based domain interaction prediction. Pamukkale University Journal of Engineering Sciences
(B-2)
1-) Arıt Türkan, Türk Erdem, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. A Platform for Comparing Protein Sets and Their Functional Annotations. HIBIT18 - 11th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT)
2-) Türk Erdem, Arıt Türkan, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. A Bioinformatics Platform for Creation and Functional Analysis of Protein Sets. International Conference of Genomics and Bioinformatics (ICGB)
3-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2017. Leveraging Taxonomic Ranks for Improving MirrorTree-based Protein Interaction Prediction. HIBIT2017 - 10th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT)
(B-3)
1-) Küçükyılmaz Cansel Hatice, Ibrahim Ahmed Hassan, Aksoy Selahattin, Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2022. VIRBIOHUB: A Central Resource for Virus Bioinformatics Research. HIBIT2022-15th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
2-) Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Karabulut Onur Can, Ibrahim Ahmad Hassan, Süzek Barış Ethem, 2022. A Coronavirus Infection and Host-Shift Predictor. The 30th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
3-) Türk Erdem, Arıt Türkan, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. ProSetComp: A Platform for Protein Set Comparisons. Proceedings of the 2018 ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics - BCB ’xx18
4-) Türk, E., Süzek, B., 2016. Assessing Impact of Taxonomic Diversity and Sequence Conservation-based Filters on Mirrortree Method. Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) 2016
5-) Türk, E., Süzek, B., Çöl, B., 2015. Detecting Boron Related Transmembrane Proteins in Bacillus Boroniphilus. HIBIT2015 - 9th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
(B-4) Papers verbally presented or published in scientific and art meetings like national conferences, symposiums, panels, and workshops
1-) Türk, E., Başar, M.E., Mutlu, O., Karaarslan, E., 2014. Üniversite için Android Tabanlı Mobil Uygulaması ve Geliştirme Sürecinde Öğrenilenler. Akademik Bilişim
(B-5)
1-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2023. Evrimsel Korunma ile Çelişen İnsanda Hastalıkla İlişkili Varyantların Tespit Edilmesi. 25. Ulusal Biyoloji Kongresi
2-) Süzek Barış Ethem, Ayaz Akif, Abak Masud Başak, Darwısh Sinem, Türk Erdem, 2023. Klinikte Yeni Nesil Dizilemenin Kullanımını Destekleyen Biyoinformatik Yaklaşımları. 18. Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi
(B-6)
1-) Uslular Göksu, Türk Erdem, Özaydın Sinan, Pembeci İzzet, 2017. Magmatik Kayaç Jeokimyası Verilerinin Yorumlanması Için Yeni Bir Web Tabanlı Uygulama: Öncel Modeller. 70. Türkiye Jeoloji Kurultayı
(C-3) Book Chapters published by publishing houses internationally renowned in the relevant field
1-) Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Ibrahim Ahmad Hassan, Karabulut Onur Can, Süzek Barış Ethem, 2023. Protein-Protein Interactions Methods and Protocols/Machine Learning Methods for Virus–Host Protein–Protein Interaction Prediction. Yayın Evi: Springer Science+Business Media/Humana Editör Adı: Mukhtar, Shahid
(E-1)
1-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 1
2-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
3-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 4
4-) Taxonomic diversity-based domain interaction prediction - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
5-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1
(E-5)
1-) ACİL SERVİSLER İÇİN BULANIK MANTIK TABANLI BİR KLİNİK KARAR DESTEK SİSTEMİ - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 2
(G-4)
1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1004. Hedefe Özgü Pan-Kanser Terapiler (PAN-TER): Akut Lenfoblastik Lösemide CAR-T Hücre Tedavilerine Yönelik Yeni Nesil Dizileme Temelli Genetik Analiz Kiti Geliştirilmesi. 2021--1
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 3501. Adenoviruslerde konak-özgüllüğü ve türler arası olası geçiş olaylarının tahmini için bir biyoenformatik sistemi geliştirilmesi. 2020-2023
(G-6)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1002. İnsan Tüm Ekzom Dizileme Tekniklerinin Kapsamadığı Klinik Önemi Olan Varyantları Tespit Eden ve Anlamlandıran Sistem. 2021-2022
(I-5)
1-) HIBIT2015 - 9th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. Turkey. . 2015