(A-1) SCI veya SCI Expanded, SSCI, AHCI tarafından taranan dergilerde yayımlanan tam makale
1-) Türk Erdem, Yüksek Ayhan, Ayaz Akif, Süzek Barış Ethem, 2023. DEVOUR: Deleterious Variants on Uncovered Regions in Whole-Exome Sequencing. PEERJ
2-) Ibrahim Ahmad Hassan, Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2023. A correlation coefficient-based feature selection approach for virus-host protein-protein interaction prediction. PLOS ONE
3-) Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Ibrahım Ahmad Hassan, Süzek Barış Ethem, 2021. ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor. Frontiers in Molecular Biosciences
(A-3) ÜAK Tarafından Kabul edilmiş olan uluslararsı alan
indeksleri tarafından taranan dergilerde yayınlanan tam
makale
1-) Özkaraca Osman, Acar Ethem, Peker Musa, Türk Erdem, 2018. ACİL SERVİSLER İÇİN BULANIK MANTIK TABANLI BİR KLİNİK KARAR DESTEK SİSTEMİ. Mühendislik Bilimleri ve Tasarım Dergisi
(A-7) ULAKBİM tarafından taranan ulusal hakemli dergilerde
yayımlanmış makale
1-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2019. Taxonomic diversity-based domain interaction prediction. Pamukkale University Journal of Engineering Sciences
(B-2) Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi
bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü olarak sunulan ve
özet metin olarak yayımlanan bildiri.
1-) Arıt Türkan, Türk Erdem, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. A Platform for Comparing Protein Sets and Their Functional Annotations. HIBIT18 - 11th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT)
2-) Türk Erdem, Arıt Türkan, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. A Bioinformatics Platform for Creation and Functional Analysis of Protein Sets. International Conference of Genomics and Bioinformatics (ICGB)
3-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2017. Leveraging Taxonomic Ranks for Improving MirrorTree-based Protein Interaction Prediction. HIBIT2017 - 10th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT)
(B-3) Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi
bilimsel, sanatsal toplantılarda poster şeklinde sunulan
ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.
1-) Küçükyılmaz Cansel Hatice, Ibrahim Ahmed Hassan, Aksoy Selahattin, Karabulut Onur Can, Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2022. VIRBIOHUB: A Central Resource for Virus Bioinformatics Research. HIBIT2022-15th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
2-) Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Karabulut Onur Can, Ibrahim Ahmad Hassan, Süzek Barış Ethem, 2022. A Coronavirus Infection and Host-Shift Predictor. The 30th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
3-) Türk Erdem, Arıt Türkan, Susuz Delikanlı Mertcan, Uçar İlayda, Süzek Barış Ethem, 2018. ProSetComp: A Platform for Protein Set Comparisons. Proceedings of the 2018 ACM International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics - BCB ’xx18
4-) Türk, E., Süzek, B., 2016. Assessing Impact of Taxonomic Diversity and Sequence Conservation-based Filters on Mirrortree Method. Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) 2016
5-) Türk, E., Süzek, B., Çöl, B., 2015. Detecting Boron Related Transmembrane Proteins in Bacillus Boroniphilus. HIBIT2015 - 9th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics
(B-4) Ulusal kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü olarak sunulan ve tam metin olarak yayımlanan bildiri
1-) Türk, E., Başar, M.E., Mutlu, O., Karaarslan, E., 2014. Üniversite için Android Tabanlı Mobil Uygulaması ve Geliştirme Sürecinde Öğrenilenler. Akademik Bilişim
(B-5) Ulusal kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel,
sanatsal toplantılarda sözlü sunulan ve özet metin olarak
yayımlanan bildiri.
1-) Türk Erdem, Süzek Barış Ethem, 2023. Evrimsel Korunma ile Çelişen İnsanda Hastalıkla İlişkili Varyantların Tespit Edilmesi. 25. Ulusal Biyoloji Kongresi
2-) Süzek Barış Ethem, Ayaz Akif, Abak Masud Başak, Darwısh Sinem, Türk Erdem, 2023. Klinikte Yeni Nesil Dizilemenin Kullanımını Destekleyen Biyoinformatik Yaklaşımları. 18. Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi
(B-6) Ulusal kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel,
sanatsal toplantılarda poster şeklinde sunulan ve özet
metin olarak yayımlanan bildiri.
1-) Uslular Göksu, Türk Erdem, Özaydın Sinan, Pembeci İzzet, 2017. Magmatik Kayaç Jeokimyası Verilerinin Yorumlanması Için Yeni Bir Web Tabanlı Uygulama: Öncel Modeller. 70. Türkiye Jeoloji Kurultayı
(C-3) Alanında tanınmış uluslararası yayınevlerince yayımlanan kitaplarda bölüm yazarlığı
1-) Karpuzcu Betül Asiye, Türk Erdem, Ibrahim Ahmad Hassan, Karabulut Onur Can, Süzek Barış Ethem, 2023. Protein-Protein Interactions Methods and Protocols/Machine Learning Methods for Virus–Host Protein–Protein Interaction Prediction. Yayın Evi: Springer Science+Business Media/Humana Editör Adı: Mukhtar, Shahid
(E-1) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI tarafından
taranan dergilerde olmak üzere adayın yazar olarak yer
almadığı SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI
tarafından taranan yayınlarda adayın eserlerine yapılan
atıf.
1-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2024 Atıf Sayısı: 1
2-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2023 Atıf Sayısı: 3
3-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 4
4-) Taxonomic diversity-based domain interaction prediction - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1
5-) ML-AdVInfect: A Machine-Learning Based Adenoviral Infection Predictor - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1
(E-5) Ulusal hakemli dergilerde adayın yazar olarak yer
almadığı yayınlarda, adayın eserlerine yapılan atıf.
1-) ACİL SERVİSLER İÇİN BULANIK MANTIK TABANLI BİR KLİNİK KARAR DESTEK SİSTEMİ - Atıf Yılı: 2020 Atıf Sayısı: 2
(G-4) TÜBİTAK, TÜBA, KOSGEB, (1002 ve 3001 hariç tüm
projeler)SBB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel
kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede görev
(araştırmacı, eğitmen, danışman vb. olarak)
1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1004. Hedefe Özgü Pan-Kanser Terapiler (PAN-TER): Akut Lenfoblastik Lösemide CAR-T Hücre Tedavilerine Yönelik Yeni Nesil Dizileme Temelli Genetik Analiz Kiti Geliştirilmesi. 2021--1
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 3501. Adenoviruslerde konak-özgüllüğü ve türler arası olası geçiş olaylarının tahmini için bir biyoenformatik sistemi geliştirilmesi. 2020-2023
(G-6) TÜBİTAK 1002 veya 3001 kapsamında desteklenen ve
tamamlanan projelerde görev (araştırmacı, eğitmen,
danışman vb. olarak)
1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1002. İnsan Tüm Ekzom Dizileme Tekniklerinin Kapsamadığı Klinik Önemi Olan Varyantları Tespit Eden ve Anlamlandıran Sistem. 2021-2022
(I-5) Uluslararası sempozyum, kongre, çalıştay, festival,
bilimsel yaz okulu, bienal, trienal gibi bilimsel, sanatsal
ve tasarıma yönelik etkinliklerde görev almak;
uluslararası spor organizasyonlarında hakemlik,
antrenörlük, idarecilik yapmak.
1-) HIBIT2015 - 9th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. Turkey. . 2015