1-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Dibek Esra, 2024. Genome-Wide Screens Identify Genes Responsible for Intrinsic Boric Acid Resistance in Escherichia coli. Biological Trace Element Research

2-) Avcı Okan, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Elgin Emine Sonay, Anık Ülkü, 2023. Development of a Highly Boron Tolerant Pseudomonas sp.-Fe-MOF Bioanode. ChemistrySelect

3-) Genç Deniz, Sezer Kürkçü Merve, Yiğittürk Gürkan, Günaydın Burcu, Elbe Hülya, Aladağ Akın, Çöl Bekir, Tarhan Emine Figen, 2022. Synovial fluid niche promoted differentiation of dental follicle mesenchymal stem cells toward chondrogenesis in rheumatoid arthritis. Archives of Rheumatology

4-) Genç Deniz, Sezer Kürkçü Merve, Günaydın Burcu, Tarhan Emine Figen, 2021. 1,25-dihydroxyvitamin D3 regulates t helper and b lymphocyte responses substantially in drug-naive primary Sjögren's syndrome patients' mononuclear cells.. TURKISH JOURNAL OF MEDICAL SCIENCES

1-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Özdağ Sevgili Hilal, Doğan Yeşim, Özkeserli Zeynep, 2022. Bacillus Boroniphilus Genom Dizisinin Tamamlanması Çalışmaları ve Gap Bölgelerindeki Transpozaz Kodlayan Gen Dizilerinin Belirlenmesi. International Journal of Innovative Approaches in Science Research

2-) Çöl Bekir, Sezer Kürkçü Merve, Sorucu Ali, 2021. Okaliptus balının PC3, CaCO2, HeLa ve HuH7 Kanser Hücre Hatları Üzerindeki Sitotoksisitesinin Değerlendirilmesi. International Journal of Innovative Approaches in Science Research

3-) Genç Deniz, Sezer Kürkçü Merve, Sezgin Serhat, 2021. Apoptotic and Antiproliferative Effect of Gingiva Mesenchymal Stem Cells on Acute Leukemia T Cells. Cyprus Journal of Medical Sciences

4-) Dibek Esra, Sezer Merve, Akgüç Nihan, Çöl Bekir, 2017. Genomic library construction of a boron tolerant bacterium in Escherichia coli and selection by boron. Turkish Journal of Molecular Biology Biotechnology

1-) Onat Kadriye Aslıhan, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2021. Some Biological Activities of Phenolic Compounds Cinnamic Acid, Caffeic Acid and P-Coumaric Acid. Journal of the Institute of Science and Technology

2-) Dibek Esra, Sezer Merve, Gökcan Çiftçi Begüm Hazar, Çöl Bekir, 2020. P1 Transduction Method to Construct Escherichia coli Mutant Strains Lacking More Than One Gene. Bitlis Eren Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi

3-) Dibek Esra, Babayeva Anara, Sezer Merve, Çöl Bekir, 2020. Bor içeren bazı biyoaktif bileşikler. Journal of Boron

4-) Sezer Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2018. Importance Of Some Metalloids In Biological Life. Mugla Journal of Science and Technology

1-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, Kasap Murat, Akpınar Gürler, 2022. Boric Acid Stress Upregulate tnaA Protein in Escherichia coli and Increased Expression of the tnaC Gene Makes The Strain More Tolerant. 2. International Cappadocia Scientific Research Congress

2-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, 2022. Overexpression of The Yjcf Gene In Escherichia Coli Enhances Boric Acid Tolerance And Knockout Of This Gene Decreases Tolerance. 2. International Cappadocia Scientific Research Congress

3-) Öztürkel Kabakaş Hatice, Onat Kadriye Aslıhan, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, 2022. LACK OF EXPRESSION OF THE queE GENE IN Escherichia coli CAUSES SENSITIVITY TO BENZOIC ACID. Ege 7th International Conference On Applied Sciences

4-) Onat Kadriye Aslıhan, Öztürkel Kabakaş Hatice, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, 2022. KNOCKOUT OF yhbE GENE IN Escherichia coli DECREASES TRANS CINNAMIC ACID TOLERANCE. Ege 7th International Conference On Applied Sciences

5-) Öztürkel Kabakaş Hatice, Onat Kadriye Aslıhan, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2022. INVESTIGATION OF THE FOOD PROTECTIVE ACTIVITIES OF BENZOIC ACID AND DERIVATIVES OCCURING NATURALLY IN FOODS. Ege 7th International Conference On Applied Sciences

6-) Onat Kadriye Aslıhan, Öztürkel Kabakaş Hatice, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2022. THE USE OF FLOW CYTOMETRY IN BACTERIOLOGY. Ege 7th International Conference On Applied Sciences

7-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Babayeva Anara, Sezer Kürkçü Merve, 2022. D-Aminoacyl-tRNA Decylase Gene Determined As a Result of Selection of Escherichia coli Genome-Wide Library Under Boric Acid Stress by Enrichment. International Conference on Global Practice of Multidisciplinary Scientific Studies Dedicated to the 100th Anniversary of "Georgian Technical University - GTU"

8-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, 2022. Phenotypic Relationship Between Boron-Containing Antibiotic Epetraborole And Escherichia Coli leuD Gene Expression. Karabakh III. International Congress Of Applied Sciences "Year Of Shusha- 2022"

9-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, 2022. Overexpression of the rplE gene in media containing epetraborole confers advantage to Escherichia coli strain against the antibiotics. Anadolu Zirvesi 4. Uluslararası Uygulamalı Bilimler Kongresi

10-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, 2021. Transposon Mutagenesis in Bacteria and Some Studies. İnternational Halich Congress on Multidisciplinary Scientific Research

11-) Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Dibek Esra, Babayeva Anara, 2021. Understanding the Relationship of Gene and Phenotype: Forward and Reverse Genetic Approaches. İnternational Halich Congress on Multidisciplinary Scientific Research

12-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Elgin Emine Sonay, 2021. Investigation of Antimicrobial Effect of Some Phenolic Compounds On Escherichia coli. International Cappadocia Scientific Research Congress

13-) Çöl Bekir, Babayeva Anara, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, 2021. Artificial Higher Expression Of Yjbo Gene Confers Tolerance Against Epetraborole Antibiotic in Escherichia Coli. Karabagh II-International Congress of Applied Sciences

14-) Babayeva Anara, Elgin Emine Sonay, Dibek Esra, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, 2021. Investigation Of Antimicrobial Effects of The Extracts Obtained From Propolis Samples Collected From Rize And Artvin Regions In Turkey. Karabagh II-International Congress of Applied Sciences

15-) Dibek Esra, Babayeva Anara, Sezer Kürkçü Merve, Çöl Bekir, Elgin Emine Sonay, 2021. In Vitro Studies on The Antimicrobial Effect of Propolis Samples Collected From Some Regions in Turkey. International Cappadocia Scientific Research Congress

16-) Genç Deniz, Sezer Merve, Günaydın Burcu, Tarhan Emine Figen, 2021. 1,25-Dihidroksivitamin D3’ün Sağlıklı Bireyler ve Primer Sjögren Sendromlu Hastaların Periferik Lenfosit Fenotipi Üzerindeki İmmunomodulatuar Etkilerinin Karşılaştırılması. International Gevher Nesibe Health Sciences Conference-VII

17-) Genç Deniz, Sezer Kürkçü Merve, Aladağ Akın, Tarhan Emine Figen, 2021. Romatoid Artrit Hastalarının Sinovial Sıvı Nişinde Dental Folikül Mezenkimal Kök Hücrelerin Kondrojenik Farklılaşması. MUNZUR ZİRVESİ 3. ULUSLARARASI UYGULAMALI BİLİMLER KONGRESİ

18-) Öztürkel Hatice, Sezer Merve, Çöl Bekir, 2020. Fenolik bileşiklerden benzoik asit, ferulik asit ve kuersetinin canlı organizmalar üzerindeki biyolojik aktiviteleri. TURK-COSE 2020: 2. International Turkic World Congress on Science and Engineering

19-) Babayeva Anara, Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Merve, 2020. DNA mikrodizin analizi ve Escherichia coli ile yapılan bazı çalışmalar. TURK-COSE 2020: 2. International Turkic World Congress on Science and Engineering

1-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Merve, Babayeva Anara, 2018. OMP encoded genes in Escherichia coli and the phenotypes of the corresponding mutants under several salt, metal and antibiotics stresses. The 4th InternationalSymposium on EuroAsian Biodiversity

2-) Sezer Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2018. Potential relationship between galactarate/glucarate/glycerate transporter GarP and boron toxicity in Escherichia coli. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

1-) Çöl Bekir, Sezer Merve, Dibek Esra, Akgüç Nihan, 2018. Identification of a gene that may be involved in providing boron tolerance to an extremophilic Bacillus isolate. 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

2-) Çöl Bekir, Sezer Merve, Dibek Esra, 2018. yfeS mutant of Escherichia coli is comparatively hypersensitive to boric acid and may play a role in boron stress response. Annual Conference 2018 of the Association for Generaland Applied Microbiology

3-) Çöl Bekir, Babayeva Anara, Dibek Esra, Sezer Merve, 2018. Boron containing antibiotics. The 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

4-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Sezer Merve, Akgüç Nihan, 2018. Identification and analysis of mRNA levels of an antiporter, excinuclease subunit and endonuclease genes in response to boron in a Pseudomonas isolate. Annual Conference2018 of the Association for General and Applied Microbiology

5-) Çöl Bekir, Dibek Esra, Kasap Murat, Akpınar Gürler, Sezer Merve, Kapısuz Gülşah, 2018. Boric Acid Stress Induction of clpP gene in Bacillus subtilis. 4th International Symposium on EuroAsian Biodiversity

6-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Merve, Akgüç Nihan, 2017. Investigation of boronrelated genes in a highly boron tolerant isolate similar to Pseudomonas zhaodongensis. International Congress on Molecular Biology andBiotechnology

7-) Dibek Esra, Çiftçi Begüm Hazar, Sezer Merve, Çöl Bekir, 2017. The effect of boric acid stress on the mRNA levels of some genes detected initially by proteomics analysis in Escherichia coli. International Congress on Molecular Biology andBiotechnology

8-) Çöl Bekir, Sezer Merve, Dibek Esra, 2017. The Bacterial Toxin-Antitoxin DinJ/YafQ module and Boron Toxicity in Escherichia coli. InternationalCongress on Molecular Biology and Biotechnology.

9-) Çöl Bekir, Demirsoy Emir, Uluçoban Niyazi, Has Gökçe, Babayeva Anara, Sezer Merve, Dibek Esra, 2017. Distinguishing the black Truffle samples purchased for commercial purposes in Turkey by molecular typing using multiplex PCR analyzes. International Congress on Molecular Biology andBiotechnology

10-) Sezer Merve, Çöl Bekir, 2016. Escherichia coli torR Mutantının Borik Asite Duyarlılıgının Belirlenmesi. Uluslararası Tarımda BorSempozyumu

11-) Çöl Bekir, Çiftçi Begüm Hazar, Kasap Murat, Sezer Merve, 2015. Proteomic Profiling of Escherichia coli Cytoplasmic Proteins under Different Boron Concentrations. Gordon Research Seminars: Applied Environmental Microbiology (GRS)

12-) Dibek Esra, Çöl Bekir, Sezer Merve, Çiftçi Begüm Hazar, Karakaya Ramazan, 2014. Çam Balından DNA izolasyonu ve S35 promotor bölgesinin gerçek zamanlı PCR analizi: manyetik boncuk kullanımının ve iki farklı PCR yaklasımının degerlendirilmesi. 4. Uluslararası Mugla Arıcılık ve Çam Balı Kongresi

1-) Sezer Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2015. Moleküler, mikrobiyolojik ve genomik yaklasımlar kullanılarak ekstremofil Staphyloccus sp. bakterisinde Bor’a karsı adaystres geninin tespit edilmesi: homolog fosfat ABC transporter. XIV. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi

2-) Dibek Esra, Sezer Merve, Çöl Bekir, 2015. Bor Madeninden izole edilmis bir Pseudomonas sp’xxnin genomik kütüphanesinin olusturulması ve Bor seleksiyonu sonucu Bor toleransına karsılık gelen astADB gen grubunun belirlenmesi. XIV. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi

3-) Dibek Esra, Sezer Merve, Çöl Bekir, 2014. Kırka Bor Madeninden Izole Edilen bir Pseudomonas putida benzeri izolatta OmpA/MotB domain proteinin belirlenmesi ve Bor tolerans aday geni olarak önerilmesi. 22. Ulusal BiyolojiKongresi

4-) Sezer Merve, Dibek Esra, Çöl Bekir, 2014. Ekstremofil bir Bacillus izolatınının genomik kütüphanesinden Bor toleransını arttırdıgı görülen bir C4 dikarboksilat ABC tasıyıcı proteininin belirlenmesi. 22. Ulusal Biyoloji Kongresi

5-) Sezer Merve, Dibek Esra, Kasap Murat, Çöl Bekir, 2013. Ekstremofil bir Staphylococcusizolatının genomik kütüphanesinin olusturulması ve Bor toleransı ile ilgili genlerin arastırılması. XIII. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi

6-) Dibek Esra, Sezer Merve, Kapısuz Gülşah, Çöl Bekir, 2013. Bir Pseudomonas izolatından bir sodyum antiport geninin rastgele klonlanması ve Escherichia coli’xxde Bor toleransında olası etkisi,. Ulusal Tıbbi Biyoloji ve Genetik Kongresi,

7-) Sezer Merve, Özdağ Hilal, Alakoç Yeşim, Özkeserli Zeynep, Çöl Bekir, 2012. Bacillus boroniphilus bakterisinin genom dizisinin tamamlanmasında ”bosluk (gap) doldurma” çalısmaları ve transpozaz kodlayan dizilerin bulunması. 21. Ulusal Biyoloji Kongresi

8-) Çöl Bekir, Sezer Merve, Güneş Hatice, Arslantürk Ahmet, 2012. Yüksek Bor toleransına sahip bir Staphylocccus aureus suşunun izolasyonu ve filogenetik analizi. 7. Ulusal Moleküler Ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi

1-) International Journal of Innovative Approaches in Science Research. 2022. Hakemlik Sayısı: 2

1-) Genomic library construction of a boron tolerant bacterium in Escherichia coli and selection by boron - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

2-) 1,25-dihydroxyvitamin D3 regulates t helper and b lymphocyte responses substantially in drug-naive primary Sjögren's syndrome patients' mononuclear cells. - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

3-) Bor içeren bazı biyoaktif bileşikler - Atıf Yılı: 2021 Atıf Sayısı: 1

1-) Bor içeren bazı biyoaktif bileşikler - Atıf Yılı: 2022 Atıf Sayısı: 1

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Escherichia coli yhjC mutant suşunun yabanıl tip suş ile 2 boyutlu jel elektroforez tabanlı proteomik analiziyle karşılaştırılması. 2022--1

2-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Escherichia coli'de KatG ve KatE Katalaz enzimlerinin spesifik aktiviteleri ile Okaliptus Balının Hidrojen Peroksit Kaynaklı Antibakteriyel Etkisi arasındaki ilişkinin Biyokimyasal Analizler ile araştırılması. 2022--1

3-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. Bazı Fenolik Asitlerin Escherichia coli Üzerindeki Etkilerinin Genom, Çözünür Proteom ve Metabolom Düzeyinde Moleküler ve Biyokimyasal Yaklaşımlar Kullanılarak Araştırılması. 2022--1

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Bor içeren antibiyotik epetraborole ve borik asitin bakteri üzerine etkisinin ASKA klonlarının fonksiyonel genomikanalizi, 2 boyutlu jel elektroforez ve transkriptomik yaklaşımlarıyla araştırılması. 2019--1

2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1001. KEIO mutant koleksiyonu, moleküler, genomik ve proteomik yaklaşımlarla Bor genlerinin araştırılması. 2015--1

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Bursiyer. Konu: . Proje Türü: -Tübitak 1002. Bor toleransı yüksek bakteri izolatlarının genomik kütüphanelerinin oluşturulması ve Bor ile ilgili genlerin araştırılması. 2012-2013

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Escherichia coli'de yfeS mutantını bor toleransı açısından komplemente eden genlerin belirlenmesi ve fenotipik biyokimyasal testlerle yfeS geninin rolünün araştırılması. 2022--1

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Farklı coğrafik bölgelerden toplanan farklı renklerde propolis örneklerinin antikanser antioksidan ve apoptoz aktivitelerinin araştırılması. 2022--1

2-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Nanofiber Biyobozunur Materyal ile Birlikte Uygulanan Dental Folikül Mezenkimal Kök Hücrelerin Romatoid Artrit Modeli Sıçanlarda Kıkırdak Doku Rejenerasyonundaki Etkisinin Araştırılması. 2021--1

3-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. 1,25-dihidroksi vitamin D3ün Primer Sjögren Sendromunda T ve B Lenfosit Yanıtları Üzerindeki Etkisinin in vitro Ortamda Araştırılması. 2020-2021

4-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Genom Boyu Taramaları ve Moleküler Genetik Yaklaşımlarıyla Escherichia Coli Bakterisinde Bor Toleransı ile İlgili Genlerin Araştırılması. 2017--1

5-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Yüksek bor toleransı gösteren Bacillus ve Staphylococcus cinsine ait bazı izolatların genomlarının fragmentize edilerek kısmi klonlanması ve Bor direnci ile ilgili genlerin araştırılması. 2012-2013