Personel

Prof.Dr. ÖMÜR BAYSAL
Prof.Dr.
Ömür Baysal
@ E-posta
omurbaysal@mu.edu.tr
Telefon
0252 211 3240 , 0252 211 5448

Kadro Bilgileri

Görev Birimi

Fen Fakültesi / Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü / Moleküler Mikrobiyoloji Abd

Kadro Birimi

Fen Fakültesi / Moleküler Biyoloji Ve Genetik Bölümü / Moleküler Mikrobiyoloji Abd

Öğrenim Bilgileri

Yüksek Lisans

Akdeniz Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitütüsü Fitopatoloji 1997

Doktora

University of Georg-August, Göttingen / Germany - -Biological Research Center (BBA) Darmstadt-Germany 20.06.2001. Fitopatoloji (Bakteriyoloji) *Additional sabbatical Post Doc. trainings and visiting researcher in Israel Volcani Center, Institute of Biosciences and Bioresources (IBBR) CNR Italy, CIRAD France, Washington D.C. USDA, University of Florida US, University of Worcester UK. (2007-2014)
University of Georg-August Göttingen, Germany 20.06.2001

Yayin Bilgileri

(A-1) SCI veya SCI Expanded, SSCI, AHCI tarafından taranan dergilerde yayımlanan tam makale

1-) Polat İlknur, Baysal Ömür, Gümrükçü Emine, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Özalp Ramazan, Çelik İbrahim, Devran Zübeyir, Polat Ersin, 2018. Molecular diversity and assessment of reactions of pepper pure line germplasm to Botrytis cinerea. Plant Protection Science
2-) Polat İlknur, Baysal Ömür, Mercati Francesco, Gümrükcü Emine, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Aranıtı Fabrızıo, Carımı Francesco, 2018. Characterization of Botyritis Cinerea isolates collected on pepper in Suthern Turkey by using molecular markers, fungucide resistance genes and virulence assay. Infection Genetics and Evolution
3-) Devran Zübeyir, Polat İlknur, Mıstanoğlu İbrahim, Baysal Ömür, 2018. A novel multiplex PCR tool for simultaneous detection of three root-knot nematodes. Australasian Plant Pathology
4-) Polat İlknur, Baysal Ömür, Gümrükçü Emine, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Özalp Ramazan, Çelik İbrahim, Devran Zübeyir, Polat Ersin, 2018. Molecular diversity and assessment of reactions of pepper pure line germplasm to Botrytis cinerea. Plant Protection Science
5-) Polat İlknur, Baysal Ömür, Mercati Francesco, Gümrükcü Emine, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Araniti Fabrizio, Carimi Francesco, 2018. Characterization of Botrytis cinerea isolates collected on pepper in Southern Turkey by using molecular markers, fungicide resistance genes and virulence assay. Infection, Genetics and Evolution
6-) Silme, R.S., Baysal, Ö., 2016. BIODEGRADATION OF ESSENTIAL OIL BY ENTEROBACTER SP. INDUCES PLANT GROWTH AND INHIBITS DAMPING-OFF PATHOGENS. Fresenius Environmental Bulletin
7-) S Ağdamar, AS Tarkan, E Keskin, N Top, E Doğaç, Ö Baysal, Ö Emiroğlu (2015) The role of environmental factors and genetic diversity on colonization success of a non-native fish, Lepomis gibbosus from western part of Turkey. Biochemical Systematics and Ecology 58, 195-203. - 2015
8-) Gürüler H., Peker M., Baysal Ö., (2015) Soft computing model on genetic diversity and pathotype differentiation of pathogens: A novel approach In press doi:10.1016/j.ejbt.2015.06.006 Electronical Journal of Biotechnology (2015) (corresponding author) - 2015
9-) Baysal Ö. & Tör M. (2014) Smart Biologics For Crop Protection in Agricultural Systems. Turk. J. Agric. For., 38, 723-731. - 2014
10-) Polat İ, Baysal Ö*., Mercati F., Kitner M., Cohen Y., Lebeda A., Carim F. (2014) Characterization of Pseudoperonospora cubensis isolates from Europe and Asia using ISSR and SRAP molecular markers. (*equal contribution and correspondent author) European Journal of Plant Pathology DOI: 10.1007/s10658-014-0420-y - 2014
11-) Bozkurt, I.A., Soylu, S., Mirik, M., Ulubas Serce, C. and Baysal, Ö. (2014), Characterization of bacterial knot disease caused by Pseudomonas savastanoi pv. savastanoi on pomegranate (Punica granatum L.) trees: a new host of the pathogen. Letters in Applied Microbiology. doi: 10.1111/lam.12309 - 2014
12-) Baysal Ö. Lai D., H-H Xu, Siragusa M., Çalışkan M., Carimi, F. , J.A.Teixeria da Silva, Tör M. (2013) A proteomic approach provides new insights into the control of soil-borne plant pathogens by Bacillus species PLoS ONE 8(1): e53182. 1-12. doi:10.1371/journal.pone.0053182 - 2013
13-) Baysal Ö., Karaaslan Ç., Siragusa M., Alessandro R., Carimi F., Pasquale F., Teixeira da Silva J.A. (2013) Molecular markers reflect differentiation of Fusarium oxysporum forma speciales on tomato and forma on eggplant Biochem. Syst. Ecol. 47: 139-147. - 2013
14-) Baysal Ö. (2013) Assessing intra-specific variation within Bacillus species using DNA fingerprinting. Fr. Env. Bull. 22: 3567- 3571. - 2013
15-) Devran Z. & Baysal Ö. (2012) Genetic characterization of Meloidogyne incognita isolates from Turkey using sequence-related amplified polymorphism (SRAP).Biologia 67/3: 535—539 (equal contribution*) - 2012
16-) Baysal Ö., Mercati F., İkten H., Çetinkaya R. Y., Aysan Y., Carimi F., Teixeira da Silva J.A. (2011).Clavibacter michiganensis subsp. michiganesis: Tracking Strains Using Their Genetic Differentiations by ISSR Markers in Southern Turkey Physiological and Molecular Plant Pathology 75: 113-119. - 2011
17-) Erdoğan O, İkten H., Baysal Ö. (2011) Molecular diversity within Pseudomonas fluorescens strains reflects their antagonistic effect differentiations to Verticillium dahliae on cotton. Romanian Biotechnological Letters.4: 6409-6416. - 2011
18-) Baysal Ö. Siragusa M., Gümrükcü E., Zengin S., Carimi F., Sajeva M., Teixeira da Silva J.A. (2010). Molecular Characterization of Fusarium oxysporum f. melongenae virulence by ISSR and RAPD Markers on Eggplant. Biochemical Genetics 48: 524-537. - 2010
19-) Baysal Ö., Siragusa M., İkten H., Polat İ., Gümrükcü E., Yiğit F., Carimi F. and Teixeira da Silva J.A. (2009)Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici races and their genetic discrimination by molecular markers in West Mediterranean region of Turkey. Physiological and Molecular Plant Pathology 74: 68-75. - 2009
20-) Baysal Ö., Çalışkan M.and Yeşilova Ö. (2008) An inhibitory effect of a new Bacillus subtilis strain (EU07) against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici. Physiological and Molecular Plant Pathology 73: 25–32. - 2008
21-) Baysal Ö, Gürsoy Y. Z, Örnek H, Çetinel B, Teixeira da Silva J.A. (2007) Enhanced systemic resistance to bacterial speck disease caused by Pseudomonas syringae pv. tomato by dl-ß-aminobutyric acid under salt stress Physiologia Plantarum 129: 493–506. - 2007
22-) Baysal Ö., C. Turgut and G.Mao (2005) Acibenzolar-S-methyl Induce Resistance in Pepper Leaves against Phytophthora capsici (Leonian) Biologia Plantarum 4:599-604. - 2005
23-) Baysal Ö., Gürsoy Y.Z. Duru A, Örnek H (2005). Induction of oxidants in tomato leaves treated with DL-ß- Amino butyric acid (BABA) and infected with Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis European Journal of Plant Pathology. 4: 361-369. - 2005
24-) Baysal Ö., Gürsoy Y.Z. Örnek H., Duru A. (2005). Enhancing tomato resistance to bacterial canker by turtle oil. Japan Phytopathology Society General Plant Pathology vol: 61: 193-198. - 2005
25-) Soylu E.M., Yigitbas H., Tok, F.M., Soylu S., Kurt S., Baysal Ö., Kaya A.D. (2005). Chemical composition and antifungal activity of the essential oil of Artemisia annua L. against foliar and soil-borne fungal pathogens Zeitschrift für Pflanzenkrankheiten und Pflanzenschutz Journal of Plant Diseases and Protection 112: 537– 542. - 2005
26-) Baysal, Ö. and Zeller W. (2004) Extract of Hedera helix induces resistance on apple rootstock M26 similar to Acibenzolar-S-methyl against Fire Blight (Erwinia amylovora) Physiological and Molecular Plant Pathology (65) 6: 305-315. - 2004
27-) Baysal Ö., Soylu S., and Soylu E.M. (2003) Induction of defence-related enzymes and resistance by the plant activator acibenzolar-S-methyl in tomato seedlings against bacterial canker caused by Clavibacter michiganensis ssp.michiganensis Plant Pathology 52: 747-753. - 2003
28-) Soylu M., Soylu S. and Baysal Ö. (2003). Induction of disease resistance and antioxidant enzymes byacibenzolar-S-methyl against bacterial wilt disease (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato. Journal of Plant Pathology 85: 1-7. - 2003
29-) Soylu S, Baysal Ö., and Soylu E.M. (2003). Induction of disease resistance by the plant activator, acibenzolar-S-methyl (ASM), against bacterial canker (Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis) in tomato seedlings Plant Science 165: 1069-1075. - 2003

(A-2) SCI veya SCI-Expanded , SSCI, AHCI tarafından taranan dergilerde yayımlanan teknik not, editöre mektup, tartışma, vaka takdimi ve özet türünden yayınlar

1-) Jimenes Quiros C, Baysal Ömür, Nicholson Paul, Mahmut Tor, 2018. Determining the antifungal activity of Bacillus species against Fusarium graminearum. PHYTOPATHOLOGY
2-) Alataş Emine Tuğba, Kara Asude, Kara Murat, Doğan Gürsoy, Baysal Ömür, 2017. Ectodermal dysplasia-skin fragility syndrome with a new mutation. Indian Journal of Dermatology, Venereology, and Leprology
3-) Gümrükcü, E., Polat, İ., Sülü, G., Kitapcı, A., Baysal, Ö., 2016. First Report of Grey Mold Caused by Botryotinia fuckeliana on Golden Berry. PLANT DISEASE
4-) S. M. Icoz, I. Polat, G. Sulu, M. Yilmaz, A. Unlu,S. Soylu, I. A. Bozkurt and Ö. Baysal (2014) First Report of Bacterial Blight of Pomegranate Caused by Xanthomonas axonopodis pv. punicae in Turkey Plant Disease (APS) 98: 1427. - 2014
5-) Baysal Ö. D. Lai, H. H. Xu, Q. L. Huang, F. Yiğit (2011) Control of late blight disease on tomato by cyclic lipopeptides of Bacillus subtilis strain (EU07). Current Opinion in Biotechnology 22S: 36-37. - 2011
6-) Baysal, Ö., P. Laux, W. Zeller (2002). Studies on induced resistance (IR) effect of the plant extract from Hedera helix against fire blight. – Phytopathology 92: 115. - 2002

(A-3) ÜAK Tarafından Kabul edilmiş olan uluslararsı alan indeksleri tarafından taranan dergilerde yayınlanan tam makale

1-) Zengin Talip, Kılıç Sercan, Yenigün Ufuk, Serhat Erdoğmuş, Baysal Ömür, 2017. A Smart Way for Talking With Proteins Proteomics. MOJ Proteomics Bioinformatics
2-) Baysal Ömür, Yıldız Ayşegül, 2017. Bacillus Subtilis: An Industrially Important Microbe for Enzymes Production. EC Microbiology
3-) Ünlü Abdullah, Baysal Ömür, Polat İlknur, Sülü Serap Melike, İkten Hatice, Devran Zübeyir, Gümrükcü Emine, 2017. Batı Akdeniz Bölgesi örtüaltı yetiştiriciliğinde sorun olan domateste Bakteriyel Benek (Pseudomonas syringae pv. tomato “Okabe” Y.D.W) hastalık etmeni izolatlarının genetik farklılıklarının moleküler yöntemlerle tespiti. derim
4-) Ünlü Abdullah, Baysal Ömür, Polat İlknur, Sülü Serap Melike, İkten Hatice, Devran Zübeyir, Gümrkcü Emine, 2017. Batı Akdeniz Bölgesi örtüaltı yetiştiriciliğinde sorun olan domateste Bakteriyel Benek (Pseudomonas syringae pv. tomato “Okabe” Y.D.W) hastalık etmeni izolatlarının genetik farklılıklarının moleküler yöntemlerle tespiti. Derim

(A-5) SCI veya SCI Expanded, SSCI, AHCI dışındaki uluslararası indexler tarafından taranan dergilerde yayımlanan tam makale

1-) Polat İlknur, Sülü Görkem, Kitapcı Aytül, Gümrükcü Emine, Baysal Ömür, 2018. Molecular fingerprinting of Botrytis cinerea population structure from different hosts. Derim
2-) Devran Zübeyir, Baysal Ömür, 2018. Induction of resistance to Meloidogyne incognita by DL-Beta amino butyric acid under salt stress condition. Australasian Plant Disease Notes

(A-5-Eski) Ulusal hakemli dergilerde yayımlanmış tam makale

1-) Ünlü Abdullah, Baysal Ömür, Polat İlknur, Sülü Serap Melike, İkten Hatice, Devran Zübeyir, Gümrükçü Emine, 2017. Batı Akdeniz Bölgesi örtüaltı yetiştiriciliğinde sorun olan domateste Bakteriyel Benek (Pseudomonas syringae pv. tomato “Okabe” Y.D.W) hastalık etmeni izolatlarının genetik farklılıklarının moleküler yöntemlerle tespiti. Derim
2-) Silme R.S., Gümrükçü E. , Özkan C.F. , Baysal Ö. (2015) "Anız Yakmanın Toprakta Mikroflora Dinamiğine Olan Etkileri", Elektronik Mikrobiyoloji Dergisi TR, cilt.12, no.1, ss.46-51, 2015 - 2015
3-) Yilmaz M., Kavak S, Baysal Ö (2014) Bazı ticari sabit ve uçucu yağların domates bakteriyel kanser ve solgunluk etmeni üzerine antibakteriyel etkileri. Derim, 31 (1):50-60 - 2014
4-) F. Yiğit, Baysal Ö., Özkan Y. Enhancer effect of boron on biological and chemical control of gray mold disease in tomato greenhouses. - 2011
5-) Baysal Ö, Gürsoy, Z.Y and Yıldız Figen (2004) ß –DL- Aminobutyric Acid and Its Using in Control of Some Important Plant Diseases (Review artıcle) Anadolu National Agrıcultural Journal 14: 105-103. - 2004
6-) Baysal Ö. (2004). Recombinant DNA and Gene Cloning Technology in Agricultural Plant Protection (review Article) Türkiye Bitkisel Araştırmalar Dergisi 1: 1-10. - 2004
7-) Baysal Ö. ve Gürsoy, Z.Y. (2003). The using possibilities of Acibenzoalr-S-methyl against tomato pests and disease (a short Turkish review in Scientific National Journal) Alata Bahce kültürleri arastirma dergisi Cilt 2 S. 2 p. 27-30. - 2003

(B-1) Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü olarak sunulan ve tam metin olarak yayımlanan bildiri

1-) Baştaş Kubilay Kurtuluş, Baysal Ömür, 2017. Screening of Erwinia amylovora strains considering gene sequencing of pathogenic islands. 4th International Conference on Sustainable Agriculture and Environment
2-) Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. Proteomic tools in plant pathology for sustainable agriculture. 4th ICSAE
3-) Arzıman Süleyman, Zengin Talip, Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. In-silico analysis on gene sequence encoding type III effector proteins reflect similar host- speciation for bacterial pathogens infecting tomato. 4th ICSAE
4-) Baysal Ö., YZ. Gürsoy, H. Örnek, A. Duru, S. Soylu, M. Soylu, W. Zeller (2005). Induction of oxidative burst in tomato leaves treated with unsaturated fatty acids of turtle oil (Caretta caretta) against Pseudomonas syringae pv. tomato. In: First International Symposium on Biological Control of Bacterial Diseases Darmstadt- Germany Berichte Biol. Bundesanst. Land- Forstwirtsch. 128 p. - 2005
5-) Soylu S., Soylu E.M., Baysal Ö, W. Zeller (2005). Antibacterial activities of essential oils from medicinal plants against the growth of Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis In: First International Symposium on Biological Control of Bacterial Diseases Darmstadt- Germany Berichte Biol. Bundesanst. Land- Forstwirtsch. 125 p. - 2005
6-) Laux, P., Baysal, Ö. and Zeller, W. (2002). Biological control of Fire blight by using Rahnella aquatilis Ra39 and Pseudomonas spec. Acta Hort. (ISHS) 590:225-230 - 2002
7-) Baysal, Ö., Laux, P. and Zeller, W. (2002). Systemic acquired resistance (SAR) –effect of BTH against fire blight. Acta Hort. (ISHS) 590:269-272 - 2002
8-) Baysal, Ö. Laux, P. Zeller W. (2002). Control of fire blight (Erwinia amylovora) with the plant activator BTH. In Proceeding IOBC/WPRS- Kusadası Biological Control of Fungal and Bacterial Plant Pathogens Vol: 25(10) pp. 135-138. - 2002
9-) Baysal, Ö., Laux, P. and Zeller, W. (2002). Further Studies on induce resistance (IR) effect of plant extract from Hedera helix against Fire Blight (E. amylovora). Acta Hort. (ISHS) 590: 273-277 - 2002
10-) Baysal, Ö., and Zeller W. (2000). Studies on control of fire blight (Erwinia amylovora) with the plant activator BION®. In Proceeding of 10th International Conference Plant Pathogenic Bacteria in Canada Kluwier Academic Publishers p.324-331. - 2000

(B-2) Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü olarak sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1-) Bayraktar Abdulahad, Süzek Tuğba, Süzek Barış Ethem, Baysal Ömür, 2019. A Meta-analysis of Gene Expression Data in Neurodegenerative Diseases. The 6th International Workshop onComputational Network Biology: Modeling, Analysis, and Control(CNB-MAC 2019)
2-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, Nadeem Saıd, 2018. Biosensor for Plant Pathogen DNA Detection with Gold Nanoparticles as Probes. 1st International Eurasian Conference on Biological andChemical Sciences (EurasianBioChem 2018)
3-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, Nadeem Saıd, 2018. The Antimicrobial Effect of Essential Oilsfrom Thymus vulgaris and Origanum vulgare on Klebsiella pneumoniae an ecofriendly approach. 1st International Eurasian Conference on Biological andChemical Sciences (EurasianBioChem 2018)
4-) Nadeem Said, Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2017. Antibacterial effect of DNA- directed silver nanoparticles on graphene oxide. 1. International University Industry cooperation RD and innovation congress
5-) Silme Ragıp Soner, Nadeem Said, Baysal Ömür, 2017. Entrepreneurship activities at universities. 1. International University Industry cooperation RD and innovation congress
6-) Baysal Ömür, Gürüler Hüseyin, Tarkan Ali Serhan, 2017. Use of artificial intelligence for prediction of genetic diversity and ecological behaviour within invasive species. II. WORKSHOP ON INVASIVE SPECIES: Global meeting on invasion ecology
7-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. Use of artificial intelligence for predicting the evolution of fungicide resistance. 4th ICSAE
8-) Demircan Çiğdem Sinem, Ercan Menekşe Didem, Baysal Ömür, 2017. Mutation screening on genes encoding adenylate cylase and Rhs elements for Sulphametoxazol- trimethoprim resistance on Vibrio anguillarum. International Conference on Agriculture, Forest, Food Sciences and Technologies (ICAFOF 2017)
9-) Baysal Ömür, 2017. Industrial potential of a new Bacillus subtilis (EU07) besides its biocontrol property. International conference of applied sciences, enginnering and mathematics ıcasem 2017
10-) Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2017. Omics Sciences and Plant Pathology. International WorkshopPlant Health: Challenges and Solutions
11-) Yilmaz, M., Sülü, S. M., Kavak, S., & Baysal, Ö. (2015). Seed Health and Film Coating. XVIII. International Plant Protection Congress, p 477, Free University, 24–27 August 2015, Berlin, Germany. - 2015
12-) Yilmaz, M., Sülü, S. M., Kavak, S., & Baysal, Ö. (2015). Seed Film Coating with Commercial Essential Oils against to Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis and its efficiency on tomato seed and seedling quality in seedling company conditions. International Plant Protection Congress, p 478, Free University, 24–27 August 2015, Berlin, Germany. - 2015
13-) Polat İ., Gümrükcü E., Sülü G., Kitapcı A., Özalp R., Çelik İ., Devran Z., Polat E. and Baysal Ö., 2015. Molecular Characterization of Fungicides Resistance of Botrytis Cinerea on Pepper and Host -Resistance of Selected Breeding Materials. “COST Action Sustain FA1208. Evolutionary Genomics of Plant Pathogens” Workshop, 26-28 August 2015, Kiel, Germany. Poster, Page: 49 - 2015
14-) Yılmaz M., İçöz S.M., Aras V., Kavas S. and Baysal Ö. (2013) Investigation on use of apple cider and wine vinegar for seed disinfection to control of bacterial fruit blotch (BFB) as a seed coating material. 30th ISTA (International Seed Testing Association )Congress, Seed Symposium Abstracts p.98 of 124. - 2013
15-) Polat I., R. Kurum, Ö. Baysal, Y. Cohen and A. Lebeda (2012) Genetic characterization of isolates of Pseudoperonospora cubensis causing downy mildew in different countries using molecular markers Cucurbitaceae Proceedings of the Xth EUCARPIA meeting on genetics and breeding of Cucurbitaceae (eds. Sari, Solmaz and Aras) Antalya (Turkey), October 15-18th. - 2012
16-) Yılmaz M,, Baysal Ö., and Zeller W. (2010). Assessing of Some Essential Oils Efficiency to Control of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis on Tomato (L. esculentum L.) 29. ISTA 2010 Seed Congress &Sympossium/Cologne/Germany P.35 - 2010
17-) Devran, Z., Baysal Ö. (2010). Use of SRAP analysis for genetic variation in Meloidogyne incognita. Pp. 108. - 2010
18-) Baysal Ö., İkten H., Çalışkan M. (2008) An efficient method in order to discrimination of genetical differences of biological control agents by molecular ISSR and RAPD markers. 2. International Symposium on Biocontrol of Bacterial Disease, Orlando Florida, USA Proceeding abstracts pp. 27. - 2008
19-) Baysal Ö., M. Çalışkan, Ö. Yeşilova (2007). Performance of EU07 in biological control of Fusarium oxysporum f.sp. radicis lycopersici. Second International Tomato Disease Symposium Kusadası -Turkey. 8- 12 October Kusadası-Turkey. Proceeding abstracts s.77 - 2007

(B-3) Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda poster şeklinde sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1-) Kurum Yigit, Sener Burak, Bozkurt Efe Berk, Korkut Ahmet, Kayran Gulperi, Savran Suna, Baştaş Kubilay Kurtuluş, Baysal Ömür, 2019. TRACKING MAJOR PLANT PATHOGENIC BACTERIA USINGMICROSATELLITES DERIVED FROM FULL GENOME SEQUENCE ANALYSIS. 6th International Conference on Sustainable Agriculture and Environment
2-) E. Gümrükçü, Ö. Baysal, A. Ünlü, M. Yılmaz and N. Karatekin (2012) Investigations on inhibitory effects of some essential oils against Fusarium oxysporum f. sp. melonis races on melon Cucurbitaceae Proceedings of the Xth EUCARPIA meeting on genetics and breeding of Cucurbitaceae (eds. Sari, Solmaz and Aras) Antalya (Turkey), October 15-18th. - 2012
3-) Devran Z. , Baysal Ö. , Söğüt M. A. (2010). Induction of resistance to root knot nematode by DL-Amino butyric acid treatment Pp. 143 - 2010
4-) Baysal Ö., Ö. Yeşilova (2007). Low abiotic stress leads to priming by DL- aminobutyric acid (BABA) treatment against Fusarium oxysporum f. sp. radicis lycopersici Second International Tomato Disease Symposium 8-12 October Kusadası -Turkey. Proceeding abstracts s.95 - 2007

(B-4) Ulusal kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü olarak sunulan ve tam metin olarak yayımlanan bildiri

1-) Baysal Ömür, Baştaş Kubilay Kurtuluş, 2019. IN-SILICO SHOTGUN METAGENOMICS DATA COMPARISON EXPANDS THE NUMBER OF POSSIBLE CANDIDATES TO BE USED FOR BIOCONTROL OF FIRE BLIGHT DISEASE. INTERNATIONAL BIOLOGICAL, AGRICULTURAL AND LIFE SCIENCE CONGRESS
2-) Ağdamar Sevan, Ünal Ayşegül, Baysal Ömür, Tarkan Ali Serhan, 2019. İstilacı Bir Türün Genetik Varyasyon Analizi: Gümüşi Havuz Balığı’nda ISSR ve SRAP Markörlerinin İlk Kullanımı. 20. Ulusal Su Ürünleri Sempozyumu (2019)
3-) Özkan C.F., Baysal Ö., Coşkun R., 2011. Atmosfere Karbon Salınımı Ve Toprak Organik Maddesi Arasındaki İlişkiler. I. Ulusal Akdeniz Orman Ve Çevre Sempozyumu 26-28 Ekim 2011, Kahramanmaraş. S:1209-1216. - 2011
4-) Baysal Ö., İkten H., Polat İ., Gümrükçü E., Çelik N., Ünlü A. (2009) Organik tarımda hastalıklarla mücadelede kullanılan biyolojik ajanların moleküler yöntemlerle karekterizasyonu. 1. GAP Organik Tarım Kongresi 17- 20 Kasım. Bildiri Özetleri s. 186. - 2009

(B-5) Ulusal kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1-) Polat İ., Gümrükcü E., Sülü G., Kitapcı A., Özalp R., Çelik İ., Devran Z., Polat E. and Baysal Ö. (2015) Örtüaltı Biber Yetiştiriciliğinde Görülen Kurşuni Küf Hastalığına Neden Olan Botrytis cinerea İzolatlarının Klasik ve Moleküler Yöntemlerle Tanımlanması. VII. Ulusal Bahçe Bitkileri Kongresi. 25-29 Ağustos 2015, Çanakkale. Sayfa:190. - 2015
2-) Baysal Ö., İkten H., Polat İ., Gümrükcü E., Ünlü A., Yiğit F. (2009) Batı Akdeniz bölgesi domates üretim seralarında Fusarium oxysporum türlerinin moleküler tekniklerle teşhisi ve ırk ayırımı Türkiye III. Bitki Koruma Kongresi, s. 182 - 2009
3-) Yiğit F., Baysal Ö., Özkan Y. Y. (2009) Domateste kurşuni küf hastalığının biyolojik ve kimyasal kontrolü üzerine borun etkisi. Türkiye III. Bitki Koruma Kongresi, Bildiri Özetleri s. 183. - 2009
4-) Baysal Ö, Gürsoy, Z.Y and Soylu S. (2004) Domates Bitkisinde Bakteriyel Benek Hastalığına Karşı Dayanıklılığın DL-ß-Amino butyric asit (BABA) Tarafından Teşvik Edilmesi I. Bitki Koruma Kongresi Samsun s.150. - 2004
5-) Baysal, Ö., and Zeller, W.(2000). Untersuchungen mit dem Pflanzenaktivator BION (BTH) II. Jahresbericht Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft Institut für biologischen Pflanzenschutz. pp. 256 - 2000
6-) Baysal, Ö., and Zeller, W. (2000). Untersuchungen zur Bekämpfung des Feuerbrandes mit dem Pflanzenaktivator BION® und zu seinem Wirkungsmechanismus.52. Deutsche Pflanzenschutztagung in Freising – Weihenstephan 9-12 Oktober, 408. - 2000
7-) Baysal, Ö. and Zeller W. (2000). Studies on plant activator BION® against fire blight.In der Arbeitskreis Phytobakteriologie Phytomedizin Nr.1. p. 25 - 2000
8-) Baysal, Ö., and Zeller, (2000). W. Systemic acquired resistance induced by BION® in Apple Rootstocks after Inoculation with fire blight. Arbeitskreis Phytopharmakologie Phytomedizin Nr.2- Juni ,40 - 2000
9-) Baysal, Ö., and Zeller, W.(1999). Untersuchungen mit dem Pflanzenaktivator BION® (BTH) I. Jahresbericht. Biologische Bundesanstalt für Land- und Forstwirtschaft Institut für biologischen Pflanzenschutz pp-260 - 1999

(B-6) Ulusal kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda poster şeklinde sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1-) Yılmaz M., İçöz S. M., Ünlü A., Baysal Ö. (2014) Nanobakırın Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis ve domates tohum canlılığı üzerine etkisinin belirlenmesi. Türkiye V. Bitki Koruma Kongresi Bildirileri , Antalya S.223. - 2014

(C-3) Alanında tanınmış uluslararası yayınevlerince yayımlanan kitaplarda bölüm yazarlığı

1-) Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2019. Volatiles and Food SecurityRole of Volatiles in Agro-ecosystems/Bacterial Volatile in Rhizosphere. Yayın Evi: Springer Singapore Editör Adı: Choudhary D.K., Sharma A.K., Agarwal P., Varma A., Tuteja N.
2-) Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2019. Mycorrhizosphere and Pedogenesis/The Beneficial Influence of Microbial Interactions on Plant Diseases and Plant Growth Promoting Effect. Yayın Evi: Springer Nature Singapore Pte Ltd. Editör Adı: Varma A., Choudhary DK.
3-) Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2019. Plant Competition in Cropping Systems/The Ecological Role of Biodiversity for Crop Protection. Yayın Evi: IntechOpen Limited Editör Adı: Daniel Dunea
4-) Baysal Ömür, Silme Ragıp Soner, 2018. Plant Competition in Cropping Systems/The Ecological Role of Biodiversity. Yayın Evi: IntechOpen Editör Adı: Daniel Dunea
5-) Silme Ragıp Soner, Baysal Ömür, 2017. Volatiles and Food Security. Springer, Singapore/Bacterial Volatile in Rhizosphere.. Yayın Evi: Springer Editör Adı: Choudhary D., Sharma A., Agarwal P., Varma A., Tuteja N.
6-) Baysal Ö. (2015) Host Resistance: SAR & ISR to plant pathogenic bacteria In: Sustainable Approaches to Controlling Plant Pathogenic Bacteria CRC Press Books ISBN 9781482240535 - CAT# K23330 35 pages - 2015
7-) Baysal Ömür, 2015. Sustainable Approaches to Controlling Plant Pathogenic Bacteria/Host Resistance: SAR and ISR to Plant Pathogenic Bacteria. Yayın Evi: CRC Press Editör Adı: V. Rajesh Kannan, Kubilay Kurtulus Bastas
8-) Baysal Ömür, 2006. Floriculture Ornamental and Plant Biotechnology Advances and TopicalIssues/Induced resistance: a new approach in plant protection forfloriculture and ornamental plants. Yayın Evi: Global Science Books Editör Adı: JA Teixeria da Silva
9-) Ö. Baysal and JA Teixeria da Silva. (2006) Induced resistance: a new approach in plant protection forfloriculture and ornamental plants. In: Floriculture, Ornamental and Plant Biotechnology advances Global Science Books UK Vol. IV. 223-231 - 2006

(D-10) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI tarafından taranan dergilerde hakemlik

1-) Frontiers in Microbiology. 2017. Hakemlik Sayısı: 2
2-) Frontiers in Plant Science. 2017. Hakemlik Sayısı: 3
3-) Biocontrol Science & Technology . 2015. Hakemlik Sayısı:
4-) Plant Pathology . 2015. Hakemlik Sayısı:
5-) Plant Disease (APS) . 2015. Hakemlik Sayısı:
6-) Journal of Proteome Research (ACS). 2014. Hakemlik Sayısı:
7-) National Academy Science Letters. 2014. Hakemlik Sayısı:
8-) Journal of Phytopathology . 2013. Hakemlik Sayısı:
9-) Proteome Science. 2013. Hakemlik Sayısı:
10-) Turkish Journal of Biology TUBITAK. 2013. Hakemlik Sayısı:
11-) European Journal of Plant Pathology. 2013. Hakemlik Sayısı:
12-) World Journal of Microbiology and Biotechnology. 2013. Hakemlik Sayısı:
13-) Scientia Horticulturae. 2013. Hakemlik Sayısı:
14-) European Journal of Soil Biology. 2013. Hakemlik Sayısı:
15-) Acta Physiologia Plantarum. 2013. Hakemlik Sayısı:
16-) Phytopathologia Mediterrenean. 2013. Hakemlik Sayısı:
17-) PLoS ONE. 2013. Hakemlik Sayısı:
18-) Physiological and Molecular Plant Pathology. 2013. Hakemlik Sayısı:
19-) Crop Protection. 2013. Hakemlik Sayısı:
20-) Current Microbiology. 2010. Hakemlik Sayısı:
21-) Journal of Plant Physiology. 2010. Hakemlik Sayısı:
22-) International Journal of Plant Production. 2010. Hakemlik Sayısı:
23-) Research Journal of Biological Sciences. 2009. Hakemlik Sayısı:
24-) World of Agricultural Sciences Journal. 2009. Hakemlik Sayısı:

(D-11) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI dışındaki uluslararası indexlerde taranan dergilerde hakemlik

1-) Alatarım. 2017. Hakemlik Sayısı: 1
2-) Turkish Journal of Phytopathology. 2017. Hakemlik Sayısı: 1

(D-2) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI dışındaki uluslararası indexlerde taranan dergilerde baş editörlük

1-) Editörlük Türü: Dergi. 2018. Derim.

(D-5) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI tarafında taranan dergilerde yardımcı editörlük/ alan editörlüğü ya da yayın kurulu üyeliği.

1-) Editörlük Türü: Dergi. 2018. Asian Journal of Biological Sciences.
2-) Editörlük Türü: Dergi. 2017. DERİM.
3-) Editörlük Türü: Dergi. 2017. American Journal of Plant Physiology.
4-) Editörlük Türü: Dergi. 2017. DERİM.
5-) Current Research Journal of Biological Sciences - 2013
6-) Turkish Journal of Agriculture and Forestry (TUBITAK) - 2013
7-) Asian Journal of Plant Pathology - 2011
8-) Asian Journal of Agricultural Sciences - 2011
9-) Eurasian Network for Scientific Information - 2011

(D-6) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI dışındaki uluslararası indekslerde taranan dergilerde yardımcı editörlük/ alan editörlüğü ya da yayın kurulu üyeliği

1-) Derim Dergisi (Moleküler bitki patolojisi alanında konu editörlüğü) - 2014
2-) Journal of Bacteriology Research - 2012
3-) Journal of Agricultural Biotechnology and Sustainable Production - 2012
4-) Journal of Microbiology and Antimicrobials - 2012
5-) Global Journal of Molecular Sciences - 2009

(F-1) Yönetiminde tamamlanmış doktora/tıpta uzmanlık/sanatta yeterlilik tezleri.

1-) BAZI UÇUCU YAĞLARIN DOMATES BAKTERİYEL KANSER ve SOLGUNLUK (Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis) ETMENİNİN KONTROLÜNDEKİ ETKİNLİĞİNİN BELİRLENMESİ ve BU YAĞLARIN FİLM KAPLAMADA KULLANIMI. - 2013

(F-2) Yönetiminde tamamlanmış yükseklisans tezleri.

1-) Tez Adı: Understanding neurodegeneration: Pathway analysis of neurodegenerative disorders by merged and meta-analyzed gene expression data. Konu: Biyoinformatik . ABDULAHAD-BAYRAKTAR. 2019

(G-1) Uluslar arası kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanmış proje yürütücülüğü

1-) 1. BMF ve Novartis ortaklığı ile araştırma projesi. Hedera helix bitki ekstraktı ve Acibenzolar-S-methyl ‘in Ateş yanıklığı hastalığına karşı dayanıklılık uyarıcı etkisi ve etki mekanizmasının araştırılması. Almanya Biyolojik Araştırmalar Enstitüsü (BBA) - 2001

(G-2) Uluslar arası kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede görev(araştırmacı, eğitmen, danışman, vb. olarak)

1-) Birleşmiş Milletler UNIDO MeBr sonlandırma Projesi bölge sorumlusu ve proje eğitimcisi - 2007
2-) Almanya, Mısır ortak DFG projesi. Rahnella aquantalis adlı bir antagonist bakterinin ateşyanıklığı hastalığına karşı kullanım etkinliğinin araştırılması Proje süresi: 1999-2001 - 2001

(G-3-Eski) TÜBİTAK, TÜBA, DPT, KOSGEB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan proje yürütücülüğü

1-) Batı Akdeniz Bölgesi sera alanlarında Fusarium oxysporum f.sp. lycopersici nin virulent ırkları ile Fusarium oxysporum f.sp. radicis lycopersici nin yaygınlığının moleküler karakterizasyonu. - 2012
2-) Bazı yağ asitlerinin bitki bakteriyel hastalıklarını engelleyici etkilerinin araştırılması - 2006

(G-4) TÜBİTAK, TÜBA, KOSGEB, (1002 ve 3001 hariç tüm projeler)SBB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede görev (araştırmacı, eğitmen, danışman vb. olarak)

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: Moleküler Mikrobiyoloji ve Genetik . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. TUBITAK COST PROJESİ 2515 No. 1130882 Örtüaltı Biber Yetiştiriciliğinde Görülen Kurşuni Küf Hastalığı (Botrytis cinerea) İzolatlarının Fungisitlere Karşı Direnç Durumunun ve Genetik Farklılıklarının Moleküler Yöntemlerle Tanımlanması, BATEM Gen Havuzunda Bulunan Islah Materyallerinin Reaksiyonlarının Belirlenmesi. 2014-2016

(G-4-Eski) TÜBİTAK, TÜBA, DPT, KOSGEB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede görev(araştırmacı, eğitmen, danışman vb, olarak)

1-) Yalancı mildyöde genetik ayırımın bazı markör genler yardımıyla belirlenmesi - 2013
2-) CNR Genetik Enstitüsü ile bakteriyel ve fungal patojenlerin genetik ayırımı konusunda işbirliği ortak çalışma programı EU ortaklığı(2006-2012) - 2012
3-) Türkiye F1 Hibrit Sebze Çeşitlerinin Geliştirilmesi ve Tohumluk Üretiminde Kamu-Özel Sektör İşbirliği Projesi. - 2009
4-) Biberde (Capsicum annuum L.) Kök Boğazı Yanıklığı (Phytophthora capsici) ve Patlıcanda (Solanum melongena) Fusarium Solgunluğu’na (Fusarium oxysporum f.sp. melongenae) Dayanıklılığı Kontrol eden Genlerin Haritalanması ve Moleküler Markırların Oluşturulması - 2009
5-) Yaş sebze ihracatında sorun olan fungal ve bakteriyel hastalıklara karşı pestisitlere alternatif mücadele yollarının araştırılması . - 2008
6-) 8. Domateste Sistemik kazanılmış Dayanıklılığın (SAR) ß-DL-Aminobütirik asit (BABA), ve Biyolojik Kontrol Ajanından Üretilmiş Bir Preperat (Serenade) ile Sağlanması ve Bunların Etkileri Üzerine Araştırmalar. - 2007
7-) Domateste Sistemik kazanılmış Dayanıklılığın (SAR) ß-DL-Aminobütirik asit (BABA), ve Biyolojik Kontrol Ajanından Üretilmiş Bir Preperat (Serenade) ile Sağlanması ve Bunların Etkileri Üzerine Araştırmalar. - 2007
8-) Türkiye’de fasulye de hastalık yapan bakteriyel etmen Pseudomonas syringae pv. phaseolicola izolatlarının farklılığının tespiti. - 2007
9-) DPT Projesi Yardimci Arastirmaci - 2004

(G-7) Tamamlanmış Bilimsel Araştırma Projelerinde (BAP) yürütücülük

1-) Xanthomonas genusuna ait bakteriyel patojenlerin moleküler marker ve MLST ile ayrımları (BAP projesi, Muğla Üniversitesi - 2013
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Moleküler Bakteriyoloji ve Genetik . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Xanthomonas genusuna ait domates ve biberde bakteriyel hastalık etmenlerinin çok yönlü sekans dizilimine ve. 2013-2016

(Ğ-2) Alanında ulusal bilimsel nitelikli ödül almak

1-) Kurum Adı: . Qiagen Turkiye tarafindan basari belgesi. 2014
2-) Kurum Adı: . TUBITAK Bilimsel yayımları teşvik ödülü. 2008
3-) TUBITAK - 2007
4-) TUBITAK - 2005
5-) TUBITAK - 2005
6-) TUBITAK - 2005
7-) TUBITAK - 2003

(H-2) Yurtiçi patent

1-) Patent Sahibi: Meral Yılmaz, Ömür Baysal, R. Soner Silme. Seed Coating Technology . 2016

Verdiği Dersler

BINF5090 2019-2020 Bahar

SEMINAR

BINF5703 2019-2020 Bahar

SPECIAL STUDIES

MBG 5090 2019-2020 Bahar

Seminer

MBG 5512 2019-2020 Bahar

MOLEKÜLER DÜZEYDE BAKTERİ GENETİĞİ

MBG 5701 2019-2020 Bahar

Uzmanlık Alan Dersi

MBG 5702 2019-2020 Bahar

Uzmanlık Alan Dersi

MBG 5703 2019-2020 Bahar

Uzmanlık Alan Dersi

MBG 5704 2019-2020 Bahar

Uzmanlık Alan Dersi

MBG2006 2019-2020 Bahar

Moleküler Mikrobiyoloji

MBG2016 2019-2020 Bahar

Moleküler Mikrobiyoloji Laboratuvarı

MBG3008 2019-2020 Bahar

Enstrumental Analiz

MBG4002 2019-2020 Bahar

Biyoinformatik II

MBG4004 2019-2020 Bahar

Bitirme Çalışması II

MBG 5516 2019-2020 Güz

BİYOİNFORMATİK DİZİ VE GENOM ANALİZİ

MBG 5553 2019-2020 Güz

MİKROBİYAL GENOMİKS

MBG2501 2019-2020 Güz

Mikrobiyal Teknoloji

MBG4001 2019-2020 Güz

Biyoinformatik I

MBG4005 2019-2020 Güz

Bitirme Çalışması I

MBG4503 2019-2020 Güz

Genomiks

MBG 5512 2018-2019 Bahar

MOLEKÜLER DÜZEYDE BAKTERİ GENETİĞİ

MBG2006 2018-2019 Bahar

Moleküler Mikrobiyoloji

MBG2008 2018-2019 Bahar

Moleküler Mikrobiyoloji Laboratuvarı

MBG3008 2018-2019 Bahar

Enstrumental Analiz

MBG3518 2018-2019 Bahar

Moleküler Düzeyde Konakçı-Patojen İlişkileri

MBG4002 2018-2019 Bahar

Biyoinformatik II

MBG4004 2018-2019 Bahar

Bitirme Çalışması II

MBG4521 2018-2019 Bahar

Meslek Staj I (20 İşgünü)

MBG 5516 2018-2019 Güz

BİYOİNFORMATİK DİZİ VE GENOM ANALİZİ

MBG 5517 2018-2019 Güz

İLERİ MOLEKÜLER MİKROBİYOLOJİ

MBG2501 2018-2019 Güz

Mikrobiyal Teknoloji

MBG3513 2018-2019 Güz

Moleküler Bakteriyoloji

MBG4001 2018-2019 Güz

Biyoinformatik I

MBG4005 2018-2019 Güz

Bitirme Çalışması I

MBG4503 2018-2019 Güz

Genomiks