Personel

Doç.Dr. EMİNE SONAY ELGİN
Doç.Dr.
Emine Sonay Elgin
@ E-posta
selgin@mu.edu.tr
Telefon
0252 211 1498

Kadro Bilgileri

Görev Birimi

Fen Fakültesi / Kimya Bölümü / Biyokimya Abd

Kadro Birimi

Fen Fakültesi / Kimya Bölümü / Biyokimya Abd

Öğrenim Bilgileri

Lisans

Karadeniz Teknik Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Kimya 01.06.1991

Yüksek Lisans

Louisiana State University, Baton Rouge, LA, USA Agricultural and Mechanical College Biochemistry 01.08.1996

Doktora

University of Wisconsin-Madison, WI, USA College of Agricultural and Life Sciences Biochemistry 25.08.2002

Yayin Bilgileri

(A-1) SCI veya SCI Expanded, SSCI, AHCI tarafından taranan dergilerde yayımlanan tam makale

1-) Çatav Şükrü Serter, Elgin Emine Sonay, Dağ Çağdaş, Stark Jaıme L, Küçükakyüz Köksal, 2018. NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize. Metabolomics
2-) Saraç, N., Uğur, A., Boran, R., Elgin, E.S., 2015. The use of boron compounds for stabilization of lipase from Psedomonas Aaeruginosa ES3 for the detergent industry. Journal of surfactants and detergents
3-) Elgin, E.S., Sökmen, N., Peterson, F.C., Volkman, B.F., Dağ, Ç., Haas, A.L., 2012. E2-binding surface on Uba3 beta-grasp domain undergoes a conformational transition. Proteins- Structure function and bioinformatics
4-) Tuinstra, R.L., Peterson, F.C., Kutlesa, S., Elgin, E.S., Kron, M., Volkman, B.F., 2008. Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state. Proceedings of National Academy of Sciences, USA
5-) Tuinstra, R.L., Peterson, F.C., Elgin, E.S., Pelzek, A., Volkman, B.F., 2007. An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity. Biochemistry
6-) Peterson, F.C., Elgin, E.S., Nelson, T., Zhang, F., Hoeger, T., Linhardt, R., Volkman, B.F., 2004. Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin. The Journal of Biological Chemistry
7-) Kuloğlu, E.S., Mccaslin, D.R., Kitabwalla, M., Pauza, C.D., Markley, J.L., Volkman, B.F., 2001. Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin. Biochemistry
8-) Kuloğlu, E.S., Mccaslin, D.R., Markley, J.L., Volkman, B.F., 2001. Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions. The Journal of Biological Chemistry
9-) Choe, S., Dzakula, Z., Kuloğlu, E.S., Markley, J.L., 1998. Assignment of 1H, 13C, and 15N signals of turkey ovomucoid third domain at pH 2.0. Journal of Biomolecular NMR

(B-2) Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda sözlü olarak sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1-) Tepeli Yudum, Ören Tuğba, Çekiç Edip Güvenç, Elgin Emine Sonay, Anık Ülkü, 2017. Development of Hemoglobin Based Electrochemical Glucose Platform. EastWest Chemistry Congress
2-) Elgin Es, Dağ Ç, Sökmen N, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. NMR studies of grasp domains from HsUba3 and HsUbe1L indicate conformational flexibility in E2 binding sites. FP7 EAST-NMR Project, Turkish NMR Meeting
3-) Elgin Es, Dağ Ç, Sökmen N, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. NMR studies of beta grasp domains from HsUba3 and HsUbe1L indicate conformational flexibility in E2 binding sites. FEBS Special Meeting Protein Quality Control and Ubiquitin Systems in Health and Disease
4-) Kuloğlu Es, Markley Jl, Mccaslin Df, Pauza Cd, Peterson Fc, Volkman Bf, 2002. Lymphotactin a C chemokine that exist in two conformational states under near physiological conditions identification of the heparin binding site. XXth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems

(B-3) Uluslararası kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda poster şeklinde sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1-) Vargün Elif, Elgin Emine Sonay, Açık Cihan, 2017. Investigation of antibacterial activity of silver nanoparticles-loaded poly(N-butyl acrylate-block-N-isopropylacrylamide) nanocomposite films. Advanced Polymers viaMacromolecular Engineering
2-) Vargün Elif, Açık Cihan, Elgin Emine Sonay, 2016. Synthesis charecterization and antibacterial activity of reduced graphene oxide poly n butylacrylate block n vinylpyrrolidone nanocomposite films. Macro 2016 World Polymer Congress
3-) Dağ Ç, Elgin Es, Ziarek Jj, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. Resonance assignments and secondary structure determination of ISG15 Activating Enzyme UBE1L UF Domain and characterization of its E2 binding site. FP7 EAST-NMR Project, Turkish NMR Meeting
4-) Dağ Ç, Elgin Es, Ziarek Jj, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2012. Characterization of E2 binding surface of ISG15 enzyme Ube1L grasp domain by NMR. FEBS Special Meeting Protein Quality Control and Ubiquitin Systems in Health and Disease
5-) Uğur Aysel, Boran Rukiye, Saraç Nurdan, Elgin Emine Sonay, 2012. Charecterization and stabilization with boron compounds of alkaline lipase from Pseudomonas Aeruginosa ES3 and its potential application as a laundry detergent additive. Protein Engineering for Biocatalysis
6-) Elgin Es, Sökmen N, Dağ Ç, Peterson Fc, Volkman Bf, Haas Al, 2011. E2 binding surface on Uba3 beta grasp domain undergoes a conformational transition in the free form. 35th Steenbock Symposium-Advances in Biomolecular NMR
7-) Kuloğlu Es, Kitabwalla M, Markley Jl, Pauza Cd, Volkman Bf, 2000. Solution structure of the human chemokine lymphotactin. XIXth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
8-) Kuloğlu Es, Markley Jl, Volkman Bf, 2000. Measurement of restricted diffusion in aligned media. 41st Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
9-) Volkman Bf, Wilkens Sj, Lytle B, Westler Wm, Kuloğlu Es, Markley Jl, 2000. Portable affordable protein structure characterization. 41st Experimental Nuclear Magnetic Resonance Conference
10-) Kuloğlu Es, Assadiporter Fm, Westler Wm, Markley Jl, 1998. The effect of reactive site P1 mutants of ovomucoid third domain from turkey on the pKa value of His57 of chymotrypsin in complex. XVIIIth International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
11-) Kuloğlu Es, Assadi-porter Fm, Westler Wm, Markley Jl, 1998. Reactive site mutants of a kazal inhibitor and their effects on the pKa value of histidine57 of chymotrypsin. 42nd Annual Meeting of Biophysical Society

(B-6) Ulusal kongre, sempozyum, panel, çalıştay gibi bilimsel, sanatsal toplantılarda poster şeklinde sunulan ve özet metin olarak yayımlanan bildiri.

1-) Demir Gül, Dağ Çağdaş, Elgin Emine Sonay, 2012. İnsan RIG 1 Cards domainlerinin ve bu domainlerin ubiquitilasyonunda rol oynayan çeşitli E3 enzimlerinin yapısal çalışmalar için üretilmesi. 26. Ulusal Kimya Kongresi
2-) Dağ Ç, Elgin Es, Ziarek Jj, Volkman Bf, Peterson Fc, Haas Al, 2012. ISG15 aktive edici E1 enzimi Ube1L UF domaininin NMR solüsyon yapısının belirlenmesi. 26. Ulusal Kimya Kongresi
3-) Dağ Çağdaş, Elgin Emine Sonay, 2009. Rekombinant insan ubiquitin aktive edici E1 enzimi beta grasp domaininin Uba1 bGD Ni sepharose kolonu üzerinde katlanması. Kromatografi 2009
4-) Sökmen Nazlı, Elgin Emine Sonay, 2007. Ubiquitin aktive edici E1 enzimlerinin ubiquitin benzeri domainlerinin saflaştırılması ve izotopik olarak işaretlenmesi. 3. Ulusal Afinite Teknikleri Kongresi

(D-10) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI tarafından taranan dergilerde hakemlik

1-) Medicinal Chemistry. 2019. Hakemlik Sayısı: 1
2-) Biochemistry. 2017. Hakemlik Sayısı: 1
3-) Journal of Proteome Research (ACS). 2015. Hakemlik Sayısı: 1

(D-6) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI dışındaki uluslararası indekslerde taranan dergilerde yardımcı editörlük/ alan editörlüğü ya da yayın kurulu üyeliği

1-) Editörlük Türü: Dergi. 2018. Mugla Journal of Science and Technology.

(E-1) SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI tarafından taranan dergilerde olmak üzere adayın yazar olarak yer almadığı SCI veya SCI-Expanded, SSCI ve AHCI tarafından taranan yayınlarda adayın eserlerine yapılan atıf.

1-) Monomeric solution structure of the prototypical 'C' chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 3
2-) Structural rearrangement of human lymphotactin, a C chemokine, under physiological solution conditions - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 2
3-) Identification and characterization of a glycosaminoglycan recognition element of the C chemokine lymphotactin - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 2
4-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 3
5-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 12
6-) E2-binding surface on Uba3 beta-grasp domain undergoes a conformational transition - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 1
7-) NMR-based metabolomics reveals that plant-derived smoke stimulates root growth via affecting carbohydrate and energy metabolism in maize - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 2

(E-6) Yurtdışında yayımlanan, adayın yazar olarak yer almadığı kitaplarda veya bildiri kitaplarında adayın eserlerine yapılan atıf

1-) An engineered second disulfide bond restricts lymphotactin/XCL1 to a chemokine-like conformation with XCR1 agonist activity - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 1
2-) Interconversion between two unrelated protein folds in the lymphotactin native state - Atıf Yılı: 2019 Atıf Sayısı: 1

(F-1) Yönetiminde tamamlanmış doktora/tıpta uzmanlık/sanatta yeterlilik tezleri.

1-) Tez Adı: TÜRKİYE MENŞELİ SIZMA ZEYTİNYAĞLARI İÇİN REFERANS NMR YÖNTEMLERİYLE OTANTİSİTE VE ORİJİN BELİRLEME METOTLARININ GELİŞTİRİLMESİ. Konu: Tez çalışması kapsamında Türkiye menşeli sızma zeytinyağları için Türkiyenin 11 farklı ilinden toplanan 300'ü aşkın zeytin örneğinden elde edilen NMR verileri kullanılarak bir data bankası oluşturulmuş ve oluşturulan bu data bankası kullanılarak zeytinlerin çeşitlerine ve coğrafi orijinlerine göre sınıflandırılmasına imkan veren yöntemler geliştirilmiştir. . Çağdaş-Dağ. 2016

(F-2) Yönetiminde tamamlanmış yükseklisans tezleri.

1-) Tez Adı: RIG-I CARD1, RIG-I CARD2, RNF125-RING-FINGER ve TRIM25-SPRY domainlerinin yapısal çalışmalarda kullanılmak amacıyla üretilmesi ve NMR ile karakterizasyonu. Konu: RIG-I CARD1, RIG-I CARD2, RNF125-RING-FINGER ve TRIM25-SPRY domainlerinin yapısal çalışmalarda kullanılmak amacıyla üretilmesi ve NMR ile karakterizasyonu. Gül-Demir. 2013
2-) Tez Adı: ISG15 aktive edici E1 enzimi Ube1L-UF domaininin NMR solüsyon yapısının belirlenmesi ve bazı insan ubiquitilasyon E3 enzimlerinin ve RIG1-CARDs'ın klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması. Konu: ISG15 aktive edici E1 enzimi Ube1L-UF domaininin NMR solüsyon yapısının belirlenmesi ve bazı insan ubiquitilasyon E3 enzimlerinin ve RIG1-CARDs'ın klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması. Çağdaş-Dağ. 2012
3-) Tez Adı: Çeşitli ubiquitin aktive edici E1 enzimlerinin ubiquitin benzeri domainlerinin klonlanması, ekspresyonu, saflaştırılması ve izotopik olarak işaretlenmesi. Konu: Çeşitli ubiquitin aktive edici E1 enzimlerinin ubiquitin benzeri domainlerinin klonlanması, ekspresyonu, saflaştırılması ve izotopik olarak işaretlenmesi. Nazlı -Sökmen. 2007

(G-1) Uluslar arası kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanmış proje yürütücülüğü

1-) Proje Durum: Devam Ediyor. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: Propolise yanıtta rol oynayan E.coli genlerinin KEIO gen nakavt koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi ve propolis ve aktif bileşenlerinin etki mekanizmalarının NMR metabolomik yöntemler ile araştırılması.. Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Propolise yanıtta rol oynayan E.coli genlerinin KEIO gen nakavt koleksiyonunun taranması ile belirlenmesi ve propolis ve aktif bileşenlerinin etki mekanizmalarının NMR metabolomik yöntemler ile araştırılması.. 2019--1

(G-2) Uluslar arası kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede görev(araştırmacı, eğitmen, danışman, vb. olarak)

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Diğer(Uluslararası). Structure of the human chemokine lymphotactin. 1998-2002

(G-3) TÜBİTAK, TÜBA, KOSGEB (1002 ve 3001 hariç tüm projeler)SBB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan proje yürütücülüğü

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. İnsan ISG15 konjugasyon sisteminde aktive edici E1 enzimi Ube1L grasp domaininin E2 enzimi ile etkileşiminde konformasyonel esnekliğin rolünün belirlenmesi. 2013-2014
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. İnsan ISG15 ve ubiquitin E2 enzimlerinin klonlanması ekspresyonu ve yapısal çalışmalarda kullanılmak üzere 15N ve 13C işaretli olarak üretilmesi. 2008-2009
3-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Ubiquitin aktive edici E1 enziminin HsUba1a ubiquitin benzeri domaininin üç boyutlu yapısının ve ubiquitin konjugasyon sistemindeki diğer bileşenler ile ektileşmelerinin Nükleer Manyetik Rezonans NMR yöntemleri ile belirlenmesi. 2005-2010

(G-4) TÜBİTAK, TÜBA, KOSGEB, (1002 ve 3001 hariç tüm projeler)SBB, Bakanlıklar vb. kamu kurumları veya özel kuruluşlarca desteklenen ve tamamlanan projede görev (araştırmacı, eğitmen, danışman vb. olarak)

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Çeşitli bis ligandlar içeren geçiş metal kompleksleri Sentez karakterizasyon DNA bağlama ve DNA kesme özellikleri. 2012-2014
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Deterjan sanayi için daha stabil yeni bir lipaz arayışı. 2011-2013
3-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Ube1L UFD ve UbcH8 proteinlerinin pET DUET1 ko ekspresyon vektörü içerisine klonlanması ko ekspresyonu ve saflaştırılması. 2011-2012
4-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Danışman. Konu: . Proje Türü: TÜBİTAK PROJESİ. Yeni azo bileşiklerinin ve azo metal komplekslerinin sentezi DNA bağlama ve kesme özelliklerinin belirlenmesi. 2010-2011

(G-7) Tamamlanmış Bilimsel Araştırma Projelerinde (BAP) yürütücülük

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Uba3 beta grasp domaininin E2 enzimleri ile etkileşiminde konformasyonel esnekliğin öneminin araştırılması. 2012-2014
2-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. RIG1 CARD1 ve RIG 1 CARD2 RNF125 ring finger ve Trim25 SPRY domainlerinin yapısal çalışmalarda kullanılmak amacıyla üretilmesi ve NMR ile karekterizasyonu. 2012-2013
3-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Yürütücü. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. RNF125 RIG I CARDS ve Trim25 SPRY domainlerinin klonlanması üretimi ve saflaştırılması. 2010-2011

(G-8) Tamamlanmış Bilimsel Araştırma Projelerinde (BAP) görev alma (araştırmacı, eğitmen, danışman vb. olarak)

1-) Proje Durum: Tamamlandı. Projedeki Görev: Araştırmacı. Konu: . Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi. Buğday Triticum aestivum L Köklerinde Alüminyum Stresine Bağlı Metabolit Değişimlerinin Nükleer Manyetik Rezonans NMR Spektroskopisi ile İncelenmesi. 2013-2015

(I-7) Alanı ile ilgili olarak; uluslararası panel, konferans, seminer, kurs, açık oturum ve söyleşi gibi etkinliklerde davetli konuşmacı ya da panelist olarak görev almak.

1-) Turkish NMR Meeting . Aralık . Türkiye . 2012

Verdiği Dersler

KİM1002 2019-2020 Bahar

Genel Kimya II

KİM5009 2019-2020 Bahar

İleri Biyokimya I (1)

KİM5541 2019-2020 Bahar

Biyokimyada Güncel Konular

KİM4015 2019-2020 Güz

Biyokimya II

KİM5551 2019-2020 Güz

Protein. Yapıları ve Fonksiyonları

CHEM 1853 2018-2019 Güz

GENERAL CHEMISTRY

KİM4015 2018-2019 Güz

Biyokimya II

KİM5008 2018-2019 Güz

İleri Biyokimya II (2)